后来在英法联军的强烈要求下，大乾朝廷才释放了幸存的俘虏。去的时候是39人，回来的只有19人了，而且都被折磨得没有了人样，于是联军就决定报复。根据他们制定的万国公法规定，凡使臣被杀，他日破城，鸡犬不留。而且额尔金还特意提出了一点，那就是一旦攻进北京城，不杀人不扰民，但一定要烧了清绮园，因为他的使节就是被关押在那里的。
此后英法联军猛攻北京城，但由于乾军拼命死守，始终未能攻克，但这更坚定了英法联军要进行报复的决心。
在猛烈炮火击败北京城外的乾军之后，英法联军攻至京郊，准备进行大规模的报复行动。在联军统帅几番商讨之后，还是决定烧毁清绮园是最好的报复方式。
在放火烧清绮园之前，额尔金还在北京城外各处张贴了告示，说明了焚烧清绮园的原因和预定的放火时间:“任何人，无论贵贱，皆需为其愚蠢的欺诈行为受到惩戒，18日将火烧清绮园，以此作为皇帝食言的惩戒，作为违反休战协定之报复。与此无关人员皆不受此行动影响，惟大乾朝廷为其负责。”但北京郊外的老百姓觉得这跟自己好像没什么关系，那个园子本来就是皇帝住的，与我何干，谁打进来归谁，爱怎么样怎么样，虐待个把囚徒你们有什么受不了的，中土多少年都是这么过来的，而且还挑出了告示中的若干语法错误。以额尔金的思维所及，中土人的心理是他理解不了的，皇帝失信，百姓麻木，为了报复，他终于下达了烧毁清绮园的命令。
敬亲王在向皇帝的奏折中是这样写的：“该夷去国万里，原为流通货物而来，全由刁恶奸徒，百端唆使，以致如此决裂。……二十二日早，因该夷抄至德胜，安定二门，事情紧急，连夜约同文博川出城，复给该夷照会，许以送还巴酋，并令巴酋写信与额酋，令其止兵。乃照会发去之后，该夷并无回字，至午间该夷已抄至德胜门土城外，暗袭僧戈仁钦，我军不战而溃，败兵纷纷退至清绮园，夷匪亦衔尾而来。”英法联军就是这样到了清绮园的。
“夷人入京，遂至宫闱，见陈设富丽，相戒勿入，云恐以失物索偿也。及夷人出，而贵族穷者，倡率奸民，假夷为名，遂先纵火，夷人还，而大掠矣。”
“焚掠淀园之祸首，非英法联军，乃为海淀一带之穷民。……二十三日甲申记：闻恭邸逃去，夷人据海淀，夷人烧清绮园，夜火光达旦烛天。二十四日乙酉记：闻夷人仅焚园外官署用房。二十五日丙戌记：今日丙外各门尽闭，……盖城外劫盗四起，只身敞衣，悉被掠夺。二十七日戊子记：闻清绮园为夷人劫掠后，奸民乘之，攘夺余物，至挽车以运之，上方珍秘，散无孑遗。……清绮园一役，其始联军仅焚园外官吏房，或为军事上必要之举动。而许多奸民土匪，即乘机劫掠，于是联军旋亦入园”。
“相当一部分乾国的普通民众直接参与了劫掠、焚毁清绮园的行动。而且，根据当事法国军官的回忆，联军之所以下焚毁清绮园的命令，一个主要的原因就是为了驱逐不断涌来参与抢劫的当地人。”
“邻近乡民及海淀贫氓纷至沓来，麇集园墙外渐近吾营，与在营土役互语，土役携有梯逐架以登，络绎越墙而入。”
“联军最后传令纵火时，各军并无火器，惟有水桶、水锅而已。 海淀土人暨土役，将携来之火线、秫秸一切引火之物齐集以待。 嗣后四处引火延烧……”
居住在清绮园周围、海淀一带，上万民众连日到清绮园抢劫。局势平息后，朝廷从当地民众手中收缴回大量文物珍宝。由此可知，清绮园被劫掠焚毁，“主犯”罪魁祸首自然是英法联军；但那些趁火打劫大发国难财的国人却是实实在在的“共犯”！
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