当卡洛斯三世进行西班牙政治改革时，他期待西班牙能够在殖民地进行改革，改善印第安人的生活和待遇，可实质上，西班牙人对于印第安人的剥削和压迫更加严重了。他来到利马向殖民地当局为同胞请命，同时希望当局承认他是印加王室后裔，这当然不会被允许。
于是在返回家乡后，他正式袭用末代印加王图帕克阿马鲁的名字，自称图帕克阿马鲁二世。美国革命爆发之后，激励了图帕克阿马鲁，在又一次请命失败后，他转而采用暴力手段。
1780年底，图帕克阿马鲁二世用计俘获了西班牙殖民官员阿里亚加，将其处死，并发布了《解放奴隶诏书》，宣布解放处于殖民社会最底层的黑人奴隶。他还大声疾呼“是时候了，消除分歧，兄弟般地团结起来”，他号召印第安人、黑人、混血种人和土生白人团结起来，为消灭“西班牙佬”而并肩战斗，并提出“打倒坏政府”的口号，起义人数很快扩大到6万。
在很短的时间内，起义军便在秘鲁的50个省中控制了24个省，人数发展到9万。在征战中，阿马鲁二世愤怒抨击封建大庄园制，揭露庄园主“强迫奴隶从清晨二时一直干到星月满天的傍晚，每天只有两个瑞尔的工资，星期日也强迫奴隶干活”，因此宣布“将实行新的土地分配制度，分给农民以足够谋生的土地”。他还宣布废除“米达”徭役制和纺织工场中使用童工的制度，取消人头税和一切苛捐杂税，决心把秘鲁从殖民****下解放出来，从而建立一个统一、平等的印第安人的国家。为了加强对起义的领导，阿马鲁二世建立了5人内阁，委任了法官和省督吏，并实行新的税收制度，开始履行政府机构的职能。
图帕克阿马鲁起义使西班牙殖民当局感到震惊，迅速调动大军，分别从利马和布宜诺斯艾利斯出发向起义军发动攻势，并高价悬赏收买阿马鲁二世的头颅。
1780年12月底，阿马鲁二世率领起义军6万人围攻印加故都库斯科古城。殖民当局利用印第安部族间的矛盾，煽动当地部分印第安酋长率其部众协同城内防军对抗起义者，因情况变化，阿马鲁二世估计难以取胜，遂决定放弃强攻该城的计划，于1781年1月10日乘夜间黑暗撤围，向南方实行战略转移。西班牙秘鲁总视察官何塞?安东尼奥?德?阿雷切和巴列元帅获悉，立即统率1。5万人殖民军分五路跟踪追击。
3月21日，阿马鲁二世率万余起义军，在殖民军必经的一个狭谷里设下埋伏，准备聚歼这股敌人。由于叛徒告密，这次伏击失利，殖民军不仅逃脱了被围歼的命运，而且摸清了起义军的主力所在。随后，在4月6日的切卡库佩战斗中，起义军被强敌打败。阿马鲁二世被迫突围，然后向南方转移，而此时他手中的部队已经寥寥无几了。
在另一位面中，阿马鲁二世再次被叛徒所出卖而被殖民当局俘虏，当西班牙人审问他谁是这次起义的同谋者时，他斩钉截铁地回答：“唯一的同谋者就是你和我，你是因为压迫人民，我是因为要把人民从这种****下解放出来。”恼羞成怒的殖民者决定尽快处死阿马鲁二世。
1781年5月18日，阿马鲁二世被押解到库斯科中央广场，四马分尸。就义之时，成千上万印第安人不顾殖民军的镇压，长跪于街头向领袖致敬诀别，表示对英雄的敬仰和哀悼。
而历史在这个时候，却出现了一个拐点。郭新，曾经在多年前协助领导过美国革命的大唐军人，在悄无声息中来到了秘鲁。
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