“孙老师莫急，朕心里已有谋画，只是需要一个借口而已。”朱由校对于孙承宗的军事才能，其实是两方面看的，一是的确军事才能突出，相当的稳重中又有创新；但另一方面只能是愚蠢之极了。
在明与后金作战连遭败绩、边防形势危如累卵的情况下，他以东阁大学士兼兵部尚书的身份亲临山海关督师，栉风沐雨，惨淡经营将近四年，力挽狂澜于既倒，招募组训了十几万辽军，选拔培养了如马世龙、袁崇焕等一批文武将领，恢复失地四百余里，修筑大城九座，小城堡四十余座，屯田五千多顷，安置战争难民近百万，逼迫**哈赤后退七百里，营造了一条令后金望面生畏的关宁防线，为后来的宁远大捷和宁锦大捷奠定了基础，在关宁期间，他制定了以辽土养辽民、以辽民守辽土的基本方针和稳固防守，逐步前进、渐图恢复的基本战略，使明军逐步从守势转为攻势，从被动转为主动。另外他还创造性地将战车、舰船和火器结合在一起，创建了以热兵器为主要杀伤手段的十二车营和中国历史上的第一支以火器为主要装备的海军，还组建了从海上登陆作战的两栖部队，并撰写了专门论述火器车战战术技术的军事著作《车营百八叩》。
而成也萧何，败也萧何，正是他的辽土养辽民的屯军计划，搞的辽东劳民伤财，自困死路。孙老师把士兵拉到离建奴几百里外去种田，搞所谓的屯战，不得不说，这是军盲的野路子。效果非常恶劣。他一把田种到大小凌河就被建奴收割，有人曾评论说：“从古征战未有陈师境上数年不进者，亦未有去敌既远虚设十余万之众坐食自困者，”。相比之下，毛文龙的东江军，秦良玉的白干兵多次和后金八旗兵进行野战，从多次交手战果来看，八旗兵并未象某些人说的那么强悍。而且明朝人力和资源多得是，在野战中和八旗兵消耗兵源，总比龟缩在城池里面，让对方绕过城池进行抢劫财物和人口（抓取当奴隶位后金生产）要好得多。历史上的，汉朝是靠着进攻打垮赶走不可一世的匈奴，而宋朝的岳飞也是靠着进攻打败金兀术比并把金国打得元气大伤，要不是汉奸秦桧，金国早就被岳飞直捣黄龙干掉了，就这样金国被岳飞打了以后基本上没了吞并南宋的能力。
所以对于孙承宗朱由校是相当矛盾的，能用，但却不能全用。
“皇上，主不可怒而兴师,将不可愠而致战，虽然归化城庇护汉奸使皇上动怒，但切不可因之而战啊！”孙承宗言辞肯切的说。
“孙老师，朕非因情而战之人，这点请孙老师放宽心，”虽然朱由校的确对北方游牧民族的确怀有忿恨之心，他们给汉族带来了太多的苦难，据他所知的从汉代开始，游牧民族就不停的侵略中原，小的每年打谷草不说，仅五胡乱华、辽国、金国、蒙古入侵，造成了多少汉族的家破人亡，多少政权又是因他们的侵略而冰雪消融。既然穿越了，那就让他为华夏民族解决这一苦难吧。但仇恨是仇恨，此次归化城方略却又是谋定而后动的，绝非因情绪而发动的战争。
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